Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Upp1P52624 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upp1P52624 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upp1P52624 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upp1P52624 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Upp1P52624 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upp1P52624 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upp1P52624 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms