Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClgnP52194 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms