Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms