Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TubP50586 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TubP50586 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TubP50586 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TubP50586 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms