Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpbP50405 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SftpbP50405 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SftpbP50405 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SftpbP50405 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SftpbP50405 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SftpbP50405 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpbP50405 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SftpbP50405 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SftpbP50405 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SftpbP50405 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpbP50405 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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