Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpdP50404 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms