Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn1cP49919 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms