Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfbP49766 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfbP49766 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfbP49766 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms