Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca1P48754 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms