Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VdrP48281 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VdrP48281 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VdrP48281 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VdrP48281 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VdrP48281 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VdrP48281 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VdrP48281 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VdrP48281 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VdrP48281 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VdrP48281 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VdrP48281 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VdrP48281 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VdrP48281 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VdrP48281 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms