Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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