Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrprbP47758 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms