Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Rpl28P41105 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Rpl28P41105 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Rpl28P41105 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms