Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tjp1P39447 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tjp1P39447 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms