Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HmgclP38060 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgclP38060 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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