Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms