Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms