Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ly6dP35459 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms