Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms