Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms