Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms