Protein–RNA interactions for Protein: P32648

Vip, VIP peptides, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VipP32648 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VipP32648 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VipP32648 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VipP32648 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VipP32648 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VipP32648 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VipP32648 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VipP32648 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VipP32648 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms