Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc5P32043 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc5P32043 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc5P32043 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc5P32043 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc5P32043 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc5P32043 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc5P32043 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc5P32043 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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