Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms