Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms