Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VtnP29788 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VtnP29788 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VtnP29788 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms