Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrgP28705 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms