Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Marcksl1P28667 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms