Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms