Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CftrP26361 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CftrP26361 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CftrP26361 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CftrP26361 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CftrP26361 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CftrP26361 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CftrP26361 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CftrP26361 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CftrP26361 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CftrP26361 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CftrP26361 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CftrP26361 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CftrP26361 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CftrP26361 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CftrP26361 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CftrP26361 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CftrP26361 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CftrP26361 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CftrP26361 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CftrP26361 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CftrP26361 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CftrP26361 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CftrP26361 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CftrP26361 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CftrP26361 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CftrP26361 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CftrP26361 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CftrP26361 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CftrP26361 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CftrP26361 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CftrP26361 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CftrP26361 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CftrP26361 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CftrP26361 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CftrP26361 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CftrP26361 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms