Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms