Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax3P24610 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax3P24610 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms