Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms