Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms