Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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