Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms