Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms