Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18533 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18533 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18533 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18533 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
P18533 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18533 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18533 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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