Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmga1P17095 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmga1P17095 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmga1P17095 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmga1P17095 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmga1P17095 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmga1P17095 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmga1P17095 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmga1P17095 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmga1P17095 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmga1P17095 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmga1P17095 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmga1P17095 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmga1P17095 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms