Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmnb1P14733 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmnb1P14733 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms