Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms