Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt8P11679 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms