Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P10404 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P10404 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P10404 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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