Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms