Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Surf1P09925 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms