Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms