Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TnfP06804 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TnfP06804 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TnfP06804 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TnfP06804 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TnfP06804 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TnfP06804 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TnfP06804 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TnfP06804 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TnfP06804 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TnfP06804 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TnfP06804 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TnfP06804 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TnfP06804 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TnfP06804 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TnfP06804 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TnfP06804 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TnfP06804 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TnfP06804 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TnfP06804 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms