Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04214 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04214 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04214 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms