Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53P02340 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tp53P02340 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms