Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01734 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01734 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01734 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01734 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01734 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01734 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01734 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01734 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01734 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01734 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01734 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms